Protein–RNA interactions for Protein: B7ZW38

HNRNPCL3, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPCL3B7ZW38 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms