Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

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Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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