Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms