Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNN4

GTF2A1L, TFIIA-alpha and beta-like factor, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1LQ9UNN4 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms