Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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