Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MIS18AQ9NYP9 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MIS18AQ9NYP9 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MIS18AQ9NYP9 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MIS18AQ9NYP9 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MIS18AQ9NYP9 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MIS18AQ9NYP9 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MIS18AQ9NYP9 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MIS18AQ9NYP9 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MIS18AQ9NYP9 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MIS18AQ9NYP9 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MIS18AQ9NYP9 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MIS18AQ9NYP9 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
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