Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJC28Q9NX36 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJC28Q9NX36 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJC28Q9NX36 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJC28Q9NX36 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJC28Q9NX36 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJC28Q9NX36 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJC28Q9NX36 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJC28Q9NX36 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJC28Q9NX36 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJC28Q9NX36 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJC28Q9NX36 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJC28Q9NX36 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJC28Q9NX36 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJC28Q9NX36 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJC28Q9NX36 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJC28Q9NX36 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJC28Q9NX36 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJC28Q9NX36 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJC28Q9NX36 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJC28Q9NX36 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJC28Q9NX36 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJC28Q9NX36 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJC28Q9NX36 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJC28Q9NX36 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJC28Q9NX36 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJC28Q9NX36 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJC28Q9NX36 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJC28Q9NX36 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJC28Q9NX36 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJC28Q9NX36 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJC28Q9NX36 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJC28Q9NX36 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJC28Q9NX36 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJC28Q9NX36 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJC28Q9NX36 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJC28Q9NX36 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJC28Q9NX36 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJC28Q9NX36 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJC28Q9NX36 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJC28Q9NX36 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNAJC28Q9NX36 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNAJC28Q9NX36 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNAJC28Q9NX36 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNAJC28Q9NX36 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNAJC28Q9NX36 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNAJC28Q9NX36 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNAJC28Q9NX36 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
DNAJC28Q9NX36 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNAJC28Q9NX36 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNAJC28Q9NX36 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
DNAJC28Q9NX36 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNAJC28Q9NX36 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNAJC28Q9NX36 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNAJC28Q9NX36 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
DNAJC28Q9NX36 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNAJC28Q9NX36 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNAJC28Q9NX36 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
DNAJC28Q9NX36 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNAJC28Q9NX36 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNAJC28Q9NX36 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNAJC28Q9NX36 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNAJC28Q9NX36 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNAJC28Q9NX36 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNAJC28Q9NX36 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNAJC28Q9NX36 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNAJC28Q9NX36 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNAJC28Q9NX36 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNAJC28Q9NX36 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNAJC28Q9NX36 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DNAJC28Q9NX36 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DNAJC28Q9NX36 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DNAJC28Q9NX36 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DNAJC28Q9NX36 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DNAJC28Q9NX36 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DNAJC28Q9NX36 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DNAJC28Q9NX36 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DNAJC28Q9NX36 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DNAJC28Q9NX36 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DNAJC28Q9NX36 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DNAJC28Q9NX36 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DNAJC28Q9NX36 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DNAJC28Q9NX36 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms