Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms