Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms