Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms