Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms