Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FGD4Q96M96 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FGD4Q96M96 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FGD4Q96M96 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FGD4Q96M96 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FGD4Q96M96 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FGD4Q96M96 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FGD4Q96M96 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
FGD4Q96M96 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FGD4Q96M96 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FGD4Q96M96 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
FGD4Q96M96 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FGD4Q96M96 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FGD4Q96M96 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FGD4Q96M96 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FGD4Q96M96 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FGD4Q96M96 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FGD4Q96M96 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FGD4Q96M96 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FGD4Q96M96 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FGD4Q96M96 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
FGD4Q96M96 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FGD4Q96M96 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FGD4Q96M96 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FGD4Q96M96 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FGD4Q96M96 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FGD4Q96M96 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FGD4Q96M96 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FGD4Q96M96 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
FGD4Q96M96 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FGD4Q96M96 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FGD4Q96M96 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FGD4Q96M96 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FGD4Q96M96 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FGD4Q96M96 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FGD4Q96M96 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FGD4Q96M96 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FGD4Q96M96 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FGD4Q96M96 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FGD4Q96M96 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FGD4Q96M96 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FGD4Q96M96 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FGD4Q96M96 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FGD4Q96M96 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FGD4Q96M96 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
FGD4Q96M96 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FGD4Q96M96 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FGD4Q96M96 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FGD4Q96M96 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FGD4Q96M96 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FGD4Q96M96 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FGD4Q96M96 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FGD4Q96M96 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FGD4Q96M96 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FGD4Q96M96 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FGD4Q96M96 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FGD4Q96M96 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FGD4Q96M96 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FGD4Q96M96 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FGD4Q96M96 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FGD4Q96M96 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FGD4Q96M96 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FGD4Q96M96 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FGD4Q96M96 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FGD4Q96M96 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
FGD4Q96M96 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FGD4Q96M96 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FGD4Q96M96 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FGD4Q96M96 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
FGD4Q96M96 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FGD4Q96M96 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FGD4Q96M96 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FGD4Q96M96 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FGD4Q96M96 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FGD4Q96M96 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms