Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms