Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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