Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms