Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

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Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF20Q5VT98 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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