Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2R2

PDSS1, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1Q5T2R2 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms