Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms