Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPRNQ16849 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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