Protein–RNA interactions for Protein: Q16526

CRY1, Cryptochrome-1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY1Q16526 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
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CRY1Q16526 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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CRY1Q16526 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
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CRY1Q16526 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
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CRY1Q16526 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
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CRY1Q16526 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
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