Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms