Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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FOXE3Q13461 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
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FOXE3Q13461 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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FOXE3Q13461 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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FOXE3Q13461 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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FOXE3Q13461 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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FOXE3Q13461 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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FOXE3Q13461 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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FOXE3Q13461 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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FOXE3Q13461 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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