Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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