Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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