Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC27.52■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC27.52■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC27.52■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC27.51■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC27.51■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC27.51■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC27.51■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms