Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms