Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms