Protein–RNA interactions for Protein: P53602

MVD, Diphosphomevalonate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVDP53602 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
MVDP53602 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
MVDP53602 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MVDP53602 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MVDP53602 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MVDP53602 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MVDP53602 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MVDP53602 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MVDP53602 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MVDP53602 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MVDP53602 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MVDP53602 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MVDP53602 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MVDP53602 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MVDP53602 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MVDP53602 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MVDP53602 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MVDP53602 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MVDP53602 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MVDP53602 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MVDP53602 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MVDP53602 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MVDP53602 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MVDP53602 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MVDP53602 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MVDP53602 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MVDP53602 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MVDP53602 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MVDP53602 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MVDP53602 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MVDP53602 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MVDP53602 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MVDP53602 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MVDP53602 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MVDP53602 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MVDP53602 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MVDP53602 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MVDP53602 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MVDP53602 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MVDP53602 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MVDP53602 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MVDP53602 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MVDP53602 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MVDP53602 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MVDP53602 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MVDP53602 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MVDP53602 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MVDP53602 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MVDP53602 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MVDP53602 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MVDP53602 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MVDP53602 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MVDP53602 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MVDP53602 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MVDP53602 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MVDP53602 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MVDP53602 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MVDP53602 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MVDP53602 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MVDP53602 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MVDP53602 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MVDP53602 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MVDP53602 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MVDP53602 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MVDP53602 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MVDP53602 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MVDP53602 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MVDP53602 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MVDP53602 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MVDP53602 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MVDP53602 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MVDP53602 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MVDP53602 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MVDP53602 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MVDP53602 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MVDP53602 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MVDP53602 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MVDP53602 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MVDP53602 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MVDP53602 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MVDP53602 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MVDP53602 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MVDP53602 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MVDP53602 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MVDP53602 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MVDP53602 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MVDP53602 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MVDP53602 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MVDP53602 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MVDP53602 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MVDP53602 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MVDP53602 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MVDP53602 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MVDP53602 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MVDP53602 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MVDP53602 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MVDP53602 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MVDP53602 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MVDP53602 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MVDP53602 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms