Protein–RNA interactions for Protein: P45379

TNNT2, Troponin T, cardiac muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT2P45379 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms