Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms