Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TM4SF1P30408 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TM4SF1P30408 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TM4SF1P30408 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TM4SF1P30408 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TM4SF1P30408 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TM4SF1P30408 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TM4SF1P30408 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TM4SF1P30408 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TM4SF1P30408 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TM4SF1P30408 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TM4SF1P30408 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TM4SF1P30408 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TM4SF1P30408 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TM4SF1P30408 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TM4SF1P30408 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TM4SF1P30408 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TM4SF1P30408 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TM4SF1P30408 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TM4SF1P30408 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TM4SF1P30408 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TM4SF1P30408 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TM4SF1P30408 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TM4SF1P30408 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TM4SF1P30408 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TM4SF1P30408 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TM4SF1P30408 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TM4SF1P30408 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TM4SF1P30408 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TM4SF1P30408 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TM4SF1P30408 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TM4SF1P30408 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TM4SF1P30408 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TM4SF1P30408 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TM4SF1P30408 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TM4SF1P30408 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TM4SF1P30408 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TM4SF1P30408 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TM4SF1P30408 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TM4SF1P30408 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TM4SF1P30408 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TM4SF1P30408 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TM4SF1P30408 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TM4SF1P30408 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TM4SF1P30408 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TM4SF1P30408 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TM4SF1P30408 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TM4SF1P30408 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TM4SF1P30408 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TM4SF1P30408 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TM4SF1P30408 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TM4SF1P30408 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TM4SF1P30408 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
TM4SF1P30408 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TM4SF1P30408 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TM4SF1P30408 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
TM4SF1P30408 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TM4SF1P30408 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TM4SF1P30408 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TM4SF1P30408 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TM4SF1P30408 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TM4SF1P30408 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TM4SF1P30408 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TM4SF1P30408 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TM4SF1P30408 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TM4SF1P30408 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TM4SF1P30408 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TM4SF1P30408 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TM4SF1P30408 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TM4SF1P30408 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TM4SF1P30408 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TM4SF1P30408 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TM4SF1P30408 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TM4SF1P30408 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TM4SF1P30408 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TM4SF1P30408 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TM4SF1P30408 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TM4SF1P30408 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TM4SF1P30408 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TM4SF1P30408 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TM4SF1P30408 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TM4SF1P30408 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TM4SF1P30408 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TM4SF1P30408 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TM4SF1P30408 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TM4SF1P30408 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TM4SF1P30408 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TM4SF1P30408 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TM4SF1P30408 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TM4SF1P30408 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TM4SF1P30408 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TM4SF1P30408 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TM4SF1P30408 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TM4SF1P30408 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TM4SF1P30408 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TM4SF1P30408 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TM4SF1P30408 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TM4SF1P30408 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TM4SF1P30408 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TM4SF1P30408 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms