Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.2 ms