Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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