Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms