Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPI1P17947 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPI1P17947 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SPI1P17947 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SPI1P17947 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPI1P17947 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPI1P17947 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPI1P17947 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPI1P17947 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPI1P17947 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPI1P17947 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPI1P17947 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPI1P17947 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPI1P17947 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPI1P17947 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPI1P17947 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPI1P17947 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPI1P17947 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPI1P17947 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPI1P17947 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPI1P17947 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SPI1P17947 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPI1P17947 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPI1P17947 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPI1P17947 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SPI1P17947 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPI1P17947 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPI1P17947 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPI1P17947 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPI1P17947 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SPI1P17947 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SPI1P17947 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SPI1P17947 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPI1P17947 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPI1P17947 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SPI1P17947 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPI1P17947 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SPI1P17947 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SPI1P17947 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SPI1P17947 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SPI1P17947 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SPI1P17947 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPI1P17947 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPI1P17947 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPI1P17947 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPI1P17947 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPI1P17947 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPI1P17947 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPI1P17947 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPI1P17947 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPI1P17947 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPI1P17947 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPI1P17947 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPI1P17947 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPI1P17947 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPI1P17947 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPI1P17947 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPI1P17947 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPI1P17947 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPI1P17947 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPI1P17947 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPI1P17947 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPI1P17947 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPI1P17947 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPI1P17947 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPI1P17947 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPI1P17947 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPI1P17947 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPI1P17947 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPI1P17947 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPI1P17947 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPI1P17947 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPI1P17947 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SPI1P17947 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPI1P17947 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPI1P17947 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPI1P17947 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SPI1P17947 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPI1P17947 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPI1P17947 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPI1P17947 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPI1P17947 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPI1P17947 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPI1P17947 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPI1P17947 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPI1P17947 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPI1P17947 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPI1P17947 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPI1P17947 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPI1P17947 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPI1P17947 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPI1P17947 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPI1P17947 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPI1P17947 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPI1P17947 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPI1P17947 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPI1P17947 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPI1P17947 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPI1P17947 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPI1P17947 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms