Protein–RNA interactions for Protein: P15529

CD46, Membrane cofactor protein, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD46P15529 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD46P15529 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD46P15529 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD46P15529 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD46P15529 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD46P15529 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD46P15529 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD46P15529 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD46P15529 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD46P15529 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD46P15529 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD46P15529 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD46P15529 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD46P15529 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD46P15529 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD46P15529 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD46P15529 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD46P15529 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD46P15529 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD46P15529 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD46P15529 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD46P15529 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD46P15529 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD46P15529 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD46P15529 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CD46P15529 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CD46P15529 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD46P15529 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD46P15529 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CD46P15529 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD46P15529 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD46P15529 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD46P15529 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD46P15529 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD46P15529 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD46P15529 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD46P15529 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD46P15529 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD46P15529 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD46P15529 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD46P15529 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD46P15529 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD46P15529 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD46P15529 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD46P15529 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD46P15529 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD46P15529 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD46P15529 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD46P15529 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD46P15529 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD46P15529 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD46P15529 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD46P15529 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CD46P15529 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD46P15529 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD46P15529 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD46P15529 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD46P15529 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD46P15529 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD46P15529 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CD46P15529 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD46P15529 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CD46P15529 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD46P15529 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CD46P15529 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD46P15529 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD46P15529 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD46P15529 RPL23A-204ENST00000422514 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD46P15529 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD46P15529 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD46P15529 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD46P15529 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD46P15529 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD46P15529 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD46P15529 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD46P15529 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD46P15529 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD46P15529 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD46P15529 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD46P15529 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD46P15529 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD46P15529 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD46P15529 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD46P15529 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD46P15529 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD46P15529 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD46P15529 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD46P15529 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD46P15529 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD46P15529 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD46P15529 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD46P15529 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD46P15529 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD46P15529 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD46P15529 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD46P15529 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD46P15529 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD46P15529 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD46P15529 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CD46P15529 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms