Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 AC113382.2-201ENST00000506911 646 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms