Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms