Protein–RNA interactions for Protein: P11441

UBL4A, Ubiquitin-like protein 4A, humanhuman

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Length 157 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL4AP11441 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBL4AP11441 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBL4AP11441 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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UBL4AP11441 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms