Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms