Protein–RNA interactions for Protein: O95819

MAP4K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP4K4O95819 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
MAP4K4O95819 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MAP4K4O95819 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MAP4K4O95819 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MAP4K4O95819 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MAP4K4O95819 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MAP4K4O95819 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
MAP4K4O95819 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MAP4K4O95819 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MAP4K4O95819 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MAP4K4O95819 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAP4K4O95819 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MAP4K4O95819 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MAP4K4O95819 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MAP4K4O95819 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MAP4K4O95819 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAP4K4O95819 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAP4K4O95819 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAP4K4O95819 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAP4K4O95819 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAP4K4O95819 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAP4K4O95819 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MAP4K4O95819 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MAP4K4O95819 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MAP4K4O95819 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MAP4K4O95819 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MAP4K4O95819 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MAP4K4O95819 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MAP4K4O95819 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MAP4K4O95819 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MAP4K4O95819 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
MAP4K4O95819 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
MAP4K4O95819 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MAP4K4O95819 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MAP4K4O95819 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MAP4K4O95819 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MAP4K4O95819 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MAP4K4O95819 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MAP4K4O95819 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MAP4K4O95819 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MAP4K4O95819 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MAP4K4O95819 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MAP4K4O95819 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MAP4K4O95819 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MAP4K4O95819 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MAP4K4O95819 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MAP4K4O95819 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MAP4K4O95819 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
MAP4K4O95819 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MAP4K4O95819 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MAP4K4O95819 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAP4K4O95819 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAP4K4O95819 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MAP4K4O95819 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAP4K4O95819 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAP4K4O95819 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAP4K4O95819 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAP4K4O95819 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAP4K4O95819 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAP4K4O95819 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAP4K4O95819 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAP4K4O95819 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MAP4K4O95819 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAP4K4O95819 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAP4K4O95819 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAP4K4O95819 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MAP4K4O95819 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAP4K4O95819 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAP4K4O95819 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAP4K4O95819 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAP4K4O95819 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAP4K4O95819 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAP4K4O95819 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAP4K4O95819 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAP4K4O95819 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAP4K4O95819 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAP4K4O95819 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAP4K4O95819 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAP4K4O95819 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MAP4K4O95819 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MAP4K4O95819 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MAP4K4O95819 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MAP4K4O95819 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MAP4K4O95819 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MAP4K4O95819 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MAP4K4O95819 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MAP4K4O95819 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MAP4K4O95819 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MAP4K4O95819 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MAP4K4O95819 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MAP4K4O95819 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MAP4K4O95819 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MAP4K4O95819 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MAP4K4O95819 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MAP4K4O95819 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MAP4K4O95819 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MAP4K4O95819 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MAP4K4O95819 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MAP4K4O95819 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MAP4K4O95819 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms