Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms