Protein–RNA interactions for Protein: O60759

CYTIP, Cytohesin-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTIPO60759 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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CYTIPO60759 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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CYTIPO60759 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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CYTIPO60759 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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CYTIPO60759 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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CYTIPO60759 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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