Protein–RNA interactions for Protein: O43734

TRAF3IP2, Adapter protein CIKS, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP2O43734 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms