Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms