Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms