Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC9.79□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms