Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms