Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KCNIP3Q9Y2W7 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KCNIP3Q9Y2W7 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KCNIP3Q9Y2W7 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KCNIP3Q9Y2W7 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KCNIP3Q9Y2W7 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KCNIP3Q9Y2W7 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KCNIP3Q9Y2W7 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KCNIP3Q9Y2W7 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KCNIP3Q9Y2W7 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KCNIP3Q9Y2W7 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KCNIP3Q9Y2W7 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KCNIP3Q9Y2W7 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KCNIP3Q9Y2W7 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KCNIP3Q9Y2W7 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KCNIP3Q9Y2W7 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KCNIP3Q9Y2W7 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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KCNIP3Q9Y2W7 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KCNIP3Q9Y2W7 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KCNIP3Q9Y2W7 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KCNIP3Q9Y2W7 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KCNIP3Q9Y2W7 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
KCNIP3Q9Y2W7 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KCNIP3Q9Y2W7 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KCNIP3Q9Y2W7 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KCNIP3Q9Y2W7 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
KCNIP3Q9Y2W7 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KCNIP3Q9Y2W7 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KCNIP3Q9Y2W7 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KCNIP3Q9Y2W7 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KCNIP3Q9Y2W7 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KCNIP3Q9Y2W7 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KCNIP3Q9Y2W7 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KCNIP3Q9Y2W7 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KCNIP3Q9Y2W7 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KCNIP3Q9Y2W7 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KCNIP3Q9Y2W7 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KCNIP3Q9Y2W7 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KCNIP3Q9Y2W7 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KCNIP3Q9Y2W7 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KCNIP3Q9Y2W7 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KCNIP3Q9Y2W7 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KCNIP3Q9Y2W7 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KCNIP3Q9Y2W7 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KCNIP3Q9Y2W7 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KCNIP3Q9Y2W7 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KCNIP3Q9Y2W7 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KCNIP3Q9Y2W7 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KCNIP3Q9Y2W7 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KCNIP3Q9Y2W7 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KCNIP3Q9Y2W7 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KCNIP3Q9Y2W7 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KCNIP3Q9Y2W7 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KCNIP3Q9Y2W7 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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KCNIP3Q9Y2W7 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KCNIP3Q9Y2W7 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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KCNIP3Q9Y2W7 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KCNIP3Q9Y2W7 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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KCNIP3Q9Y2W7 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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KCNIP3Q9Y2W7 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNIP3Q9Y2W7 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNIP3Q9Y2W7 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNIP3Q9Y2W7 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNIP3Q9Y2W7 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNIP3Q9Y2W7 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNIP3Q9Y2W7 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNIP3Q9Y2W7 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNIP3Q9Y2W7 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNIP3Q9Y2W7 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNIP3Q9Y2W7 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNIP3Q9Y2W7 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNIP3Q9Y2W7 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNIP3Q9Y2W7 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNIP3Q9Y2W7 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNIP3Q9Y2W7 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNIP3Q9Y2W7 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNIP3Q9Y2W7 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNIP3Q9Y2W7 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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