Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJV3

MID2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID2Q9UJV3 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms